Setelah kelulusannya dari SMP, Kuroko Tetsuya & Kagami Taiga pun sekarang mendaftar di SMA Seirin dan mereka dengan mendaftar dan bergabung dengan klub basket. Senior-senior di klub Basket terkejut dengan bakat Kagami yang luar biasa dan Kuroko yang mempunyai hawa kehadiran yang tipis. Ternyata, saat di SMP, Kuroko ialah seorang pemain misterius yang dijuluki “Pemain Bayangan Keenam”, Kuroko bermain bersama lima pemain jenius lainnya yang sering dijuluki sebagai “Generasi Keajaiban” dan telah menjuarai kejuaraan 3 kali berturut-turut. Kombinasi baru yang lahir, “Cahaya” & “Bayangan” yang dimainkan Kagami dan Kuroko akan menjadi kunci permainan yang mengagumkan di tim SMA Seirin dan sekarang telah berhasil mencapai tingkat nasional setelah mereka menjuarai turnamen Winter Cup dengan mengalahkan “Generasi Keajaiban”.

Kuroko sekarang telah menginjak kelas dua SMA. Sebuah Tim basket jalanan yang bernama “Jabberwock” dari Amerika datang ke Jepang untuk pertandingan persahabatan dengan tim Jepang. Sayangnya, setelah tim Jepang kalah telak dengan tim Jabberwock, Jabberwock sekarang mulai mengejek permainan basket Jepang. Ayah Riko, Aida Kagetora mendengar hal tersebut segera membentuk sebuah tim dengan mengumpulkan lima anggota “Generasi Keajaiban” ditambah Kuroko dan Kagami dengan tujuan mengalahkan Jabberwock. Tim yang kemudian dinamakan “Vorpal Swords” ini pun siap membalaskan kekalahan telak Jepang dari Jabberwock.